SMA’da Genetik Taramanın Yeni Yolu

Çin'deki araştırmacılar, spinal müsküler atrofinin (SMA) genetik teşhisi için hızlı ve güvenilir bir yol geliştirdiklerini ve  bunun hastalığı olmayan ancak yine de çocuklarına geçirebilen taşıyıcıları tespit ettiğini bildirdiler. Kütle spektrometrisi-kopya sayısı varyasyonu veya MS-CNV olarak adlandırılan yeni yöntemin, iki bağımsız numune grubunda altın standart multipleks ligasyon probu amplifikasyonu (MLPA) yöntemi kadar etkili olduğu bulundu, ancak sonuç sağlamak için önemli ölçüde daha az zaman gerektirdiği bildirildi. "Spinal müsküler atrofi genetik testi için MALDI-TOF kütle spektrometrisi ile SMN1 ve SMN2 kopya numaralarının eşzamanlı ölçümü" bulguları Clinica Chimica Acta dergisinde yayınlandı. Neredeyse tüm SMA vakaları, SMN1 geninin her iki kopyasında da ekson 7'nin tam kaybından kaynaklanır ve bu hastalarda aynı anda ekson 7 ve 8 kaybı da yaygındır. Eksonlar, bir genin protein üretmek için gerekli bilgileri içeren bölümleridir. Bir "yedek" SMN geninin kopya sayısı, SMN2, SMA şiddetini etkiler ve daha yüksek bir sayı tipik olarak daha az şiddetli hastalığı tahmin eder. SMN1 ve SMN2 arasında ekson 7 ve 8'de tek bir nükleotid farkı vardır ve nükleotidler DNA'nın yapı taşlarıdır. SMN1 geninin her iki kopyasında ekson 7 ve ekson 8 kaybının saptanması, bir SMA tanısını taramak ve doğrulamak için etkili bir yol iken, yalnızca bir mutasyona uğramış gen kopyasının varlığı taşıyıcıları tanımlayabilmektedir. Etnik kökenlerde her 40 ila 50 kişiden biri olan bu taşıyıcılar, hastalıktan etkilenmezler, ancak hatalı geni çocuklarına geçirebilirler. Aile planlaması yapan yetişkinlere uygun genetik danışmanlık için taşıyıcıların belirlenmesi esastır. Son birkaç yılda yenidoğan ve taşıyıcı SMA taraması için çeşitli yöntemler geliştirilmiştir.

Araştırmacılar, onaylanmış SMA tedavilerinin mevcudiyeti, daha erken teşhis ve tedavi ile daha iyi sonuç alma eğilimi göz önüne alındığında, makul bir maliyetle SMN1 ve SMN2 kopya numaralarının eşzamanlı nicelleştirilmesini sağlayan yüksek verimli bir yöntemin SMA'nın yönetimini büyük ölçüde kolaylaştırabileceğini düşündüklerini belirtmişlerdir. Bunu akılda tutarak, büyük ölçüde Wenzhou Tıp Üniversitesi'ndeki bir araştırma ekibi, MS-CNV adlı SMA yenidoğan ve taşıyıcı taraması için rekabetçi PCR ve MALDI-TOF kütle spektrometrisi olarak adlandırılan iki tekniği birleştiren yeni bir yöntem geliştirdi. Bu tahlil, hem SMN1 hem de SMN2 genlerindeki ekson 7 ve 8'in kopya sayısının yanı sıra yakındaki NAIP genindeki ekson 5'in  eş zamanlı olarak belirlenmesine olanak tanımaktadır.

Yeni yöntem, taşıyıcı taramasını ve SMA’nın erken teşhisini önemli ölçüde kolaylaştırabilir

MS-CNV'nin başlangıçta 20 DNA örneğinde SMN1, SMN2 ve NAIP'nin iki kopyasını doğru bir şekilde saptadığı ve aynı örnekler farklı tarihlerde yeniden test edildiğinde sonuçların tekrarlanabilir olduğu bulundu. Daha sonra yöntem, paralel olarak çalışan multipleks ligasyona bağlı prob amplifikasyonu veya MLPA testleri olan iki bağımsız SMA hastası, taşıyıcı ve sağlıklı birey grubundan alınan numunelerde doğrulandı. SMA taraması için altın standart yöntem olan MLPA, genlerin ve bireysel ekzonların kopya sayısını değerlendirmektedir. Ekip, önemli olarak, bir yöntemden elde edilen belirsiz bir değerin, diğer yöntemden elde edilen belirsiz bir değerle düzeltilebileceğini belirtti. Bu bulgular, MS-CNV'nin doğruluğu ve yüksek örnek işleme verimi göz önüne alındığında, hem SMN1 hem de SMN2 için dozaj bilgisi sağlayarak, SMA'nın taşıyıcı taraması ve genetik teşhisi için kullanılabileceğini vurguladı. Araştırmacılar geliştirdikleri yöntemin, laboratuvar prosedürleri ve veri analizi dahil olmak üzere toplam tahlil süresinin yaklaşık 6,5 ila 7 saat sürdüğünü ve bunun hem uygulamalı hem de genel süre için MLPA'ya göre önemli bir gelişme olduğunu sözlerine eklediler. Ekip, SMN1 ve SMN2 gen kopya sayılarının nicelleştirilmesine yönelik bu yüksek oranda otomatikleştirilmiş yöntemin, taşıyıcı taramasını ve SMA'nın erken teşhisini ve ayrıca etkili tedavi için uygun hastaları belirlemeyi büyük ölçüde kolaylaştırabileceğini belirtti.